Les chercheurs du CEE sont très largement impliqués dans les programmes d’enseignement de Sciences Po à tous les niveaux. Ils sont affiliés à quatre départements (science politique, sociologie, droit et histoire) ainsi qu’à l’École d'Affaires internationales, à l’École urbaine et à l’École d'Affaires publiques. Ils enseignent également hors les murs.