Nadia Marzouki est titulaire d'un doctorat en sciences politiques de Sciences Po (2008) et est chargée de recherche au CNRS.

Ses recherches et publications portent sur les relations entre religion et politique, principalement dans les contextes nord-américain, méditerranéen et nord-africain. Elle a notamment effectué des recherches de terrain aux États-Unis, en Italie, en Algérie et en Tunisie. Son approche, qualitative, comparative et interdisciplinaire, s’inscrit à la croisée de la sociologie politique, de la sociologie des religions, du droit et de la théorie politique.

Nadia Marzouki est l'auteure de Islam, an American Religion (Columbia University Press en 2017), traduction actualisée de L’Islam, une Religion Américaine, paru au Seuil en 2013. Elle a codirigé Religious Conversions in the Mediterranean World (Palgrave, Macmillan, 2013) avec Olivier Roy. Elle a codirigé Saving the People, How Populists Hijack Religion (Hurst and Oxford University Press, 2017) avec Olivier Roy et Duncan McDonnell. Elle a codirigé Politiques de Lutte contre la Radicalisation (Presses de Sciences Po, 2022) avec Juliette Galonnier et Stéphane Lacroix.

Nadia Marzouki prépare actuellement un manuscrit (en vue de l’obtention de l'Habilitation à Diriger des Recherches) qui examine la façon dont les mobilisations théo-morales de désobéissance civile créent de nouveaux imaginaires et espaces démocratiques. Ce projet de livre s'appuie sur un travail de terrain multisitué de cinq ans mené aux États-Unis (en Caroline du Nord et en Pennsylvanie), en Italie et en Tunisie.

De 2012 à 2016, Nadia Marzouki a fait partie de l'équipe de recherche du projet ReligioWest, financé par le Conseil européen de la recherche et dirigé par Olivier Roy. Elle a passé une année en tant que chercheuse invitée au Ash Center de la Kennedy School de l'Université de Harvard (2016-2017). Au printemps 2018, elle a donné un cours intitulé Muslims in the United States : Contests over Religious Freedom and Citizenship à la faculté de droit de l'université de Yale. Au cours de l'année 2023-2024, elle a été membre de l'École des sciences sociales à l’Institute for Advanced Study de Princeton. A Sciences Po, elle est membre du conseil scientifique de la Chaire d’Étude sur le Fait Religieux et du conseil scientifique du Programme sur le Moyen Orient et l’Afrique du Nord. Elle a été membre du Conseil d’Unité du CERI (2019-2023).

Nadia Marzouki a dédié une partie de son travail aux activités de transfert et de valorisation de la recherche. Entre 2018 et 2023, Nadia Marzouki a dirigé l'IRN (Réseau international de recherche) Contextualizing Radicalization-The Politics of Violent Extremism (2018-2023), financé par le CNRS. Elle a fondé et dirigé le réseau RTP (Réseau Thématiques Pluridisciplinaire) « Islams et chercheurs dans la cité » financé par le CNRS entre 2016 et 2020.

Nadia Marzouki encadre des étudiant.e.s de master et co-dirige des doctorant.e.s travaillant sur les pratique religieuse et le rapport entre religion et politique en Afrique du Nord ou en Europe. Au printemps 2024, elle donnera un cours dans le cadre de la Formation Académique Commune du Master sur la religion et le populisme à Science Po.